近五年科研项目：

1. 国家重点研发计划青年科学家项目，2021YFD1201400，长日照适应性二倍体马铃薯种质资源创新与利用，2021-12至2026-11，120万，参加单位负责人

2. 国家自然科学基金委员会，国家自然科学基金地区项目，31660415，马铃薯加倍一倍体群体创建与块茎重量遗传分析，2017-01至2020-12，39万元，主持

3. 中央引导地方科技发展资金，马铃薯大规模突变体库创建与解析，2022-08至2024-07，20万元，主持

4. 现代农业产业技术体系岗位科学家项目，农业农村部，CARS-09-P17，国家马铃薯产业技术体系，病虫害防控研究室岗位专家、研究室主任，2021-01至2025-12，275万元，参加，骨干成员

5. 内蒙古自治区杰出青年培育项目，2016JQ03，2016-01至2018-12，30万元，主持

6. 内蒙古自治区科技创新引导奖励资金，国外马铃薯种质资源引进、评价与应用，60万元，2017-01至2018-12，主持

代表性论文：

1. Miru Du, Ting Wang, Qun Lian, Xiaojie Zhang, Guohui Xin, Yuanyuan Pu, Glenn J Bryan, Jianjian Qi. Developing a new model system for potato genetics by androgenesis, Journal of Integrative Plant Biology, 2021, 63(4): 628-633. (生物学一区TOP, IF=7.06, 通讯作者)

2. Jianjian Qi, Xin Liu, Di She, Han Miao, Bingyan Xie, Xixiang Li, Peng Zeng, Shenhao Wang, Yi Shang, Xingfang Gu, Yongchen Du, Ying Li, Tao Lin, Jinhong Yuan, Xueyong Yang, Jinfeng Chen, Huiming Chen, Xingyao Xiong, Ke Huang, Zhangjun Fei, Linyong Mao, Li Tian, Thomas Städler, Susanne S Renner, Sophien Kamoun, William J Lucas, Zhonghua Zhang, Sanwen Huang. A genomic variation map provides insights into the genetic basis of cucumber domestication and diversity. Nature Genetics, 2013, 45(12): 1510-1515. (生物学一区TOP、Nature Index期刊, IF=41.30, 第一作者)

3. Guochao Xuanyuan, Qun Lian, Ruifang Jia, Miru Du, Liru Kang, Yuanyuan Pu, Zhiwei Zhang, Jianjian Qi, Zhao Jun. Genome-wide screening and identification of Nuclear Factor-Y family genes and exploration their function on regulating abiotic and biotic stress in potato (Solanum tuberosum L.). Gene, 2022, 812:146089. (生物学三区, IF=3.688, 共同通讯作者)

4. Jing Lv, Jianjian Qi, Qiuxiang Shi, Di Shen, Shengping Zhang, Guangjin Shao, Hang Li, Zhanyong Sun, Yiqun Weng, Yi Shang, Xingfang Gu, Xixiang Li, Xiaoguo Zhu, Jinzhe Zhang, Robbert Treuren, Willem Dooijeweert, Zhonghua Zhang, Sanwen Huang. Genetic Diversity and Population Structure of Cucumber (Cucumis sativus L.). PLoS ONE, 2012, 7(10): e46919. (生物学三区，IF=4.092, 共同第一作者)

5. Chunzhi Zhang, Pei Wang, Die Tang, Zhongmin Yang, Fei Lu, Jianjian Qi, Nilesh R. Tawari, Yi Shang, Canhui Li, Sanwen Huang. The genetic basis of inbreeding depression in potato. Nature Genetics, 2019, 51: 374-378. (生物学一区TOP、Nature Index期刊, IF=41.30, 一般参加)